Albator et son équipage sont à la recherche d'une planète idéale où la paix règnerait. La Terre et une partie de l'univers sont en effet sous la coupe des Humanoïdes, et ces derniers font tout pour éliminer le célèbre corsaire, qui constitue une entrave à leur autorité dictatoriale. C'est principalement le professeur Zon, un traître terrien à la solde de l'ennemi, qui va donner la chasse à Albator, désireux de prouver que les redoutables vaisseaux qu'il créé sont supérieurs à celui de notre héros. Mais ce dernier n'est pas seul dans l'univers...
Saison 1
Épisode 1 - Le grand départ
Épisode 2 - La femme capitaine
Épisode 3 - Petite fille
Épisode 4 - Plus forte que l'épée
Épisode 5 - Le bateau fantôme
Épisode 6 - L'oasis de l'espace
Épisode 7 - La vengeance
Épisode 8 - La planète de fer
Épisode 9 - Sabotage
Épisode 10 - Il neige dans l'espace
Épisode 11 - L'invasion
Épisode 12 - Le grand défi
Épisode 13 - La déesse dorée
Épisode 14 - La boule de feu
Épisode 15 - La mer de la mort
Épisode 16 - Les chats ont deux oreilles
Épisode 17 - Le vaisseau ne répond plus
Épisode 18 - Au secours d'Emeraldas
Épisode 19 - Le mystère de l'ordinateur
Épisode 20 - Le mal de l'espace
Épisode 21 - L'ordinateur
Épisode 22 - La déesse de la paix